Jest to strzelanina przeznaczona do singlowych rozgrywek. Bohaterowie gry walczą z oponentami, mając na sobie nanoskafander o nadludzkich możliwościach. Gra jest kontynuacją produkcji o tym samym tytule z 2007 r. Akcja więc toczy się trzy lata później od wydarzeń rozgrywających się w pierwszej części. Przez ten okres czasu pod wpływem działań obcych, Ziemia stała się jednym wielkim polem walki.

Obecnie największe miasta świata stały się ogromnymi, zrujnowanymi, opuszczonymi przez ludzi miejscami. Po ich ulicach poruszają się sondy wroga. Nawet niebo zostało sterroryzowane przez obcych i teraz latają po nim potężne statki kosmiczne patrolujące z góry Ziemię. Gracz zostaje wrzucony w sam środek Nowego Jorku, gdzie zostaje zmuszony do walki z obcymi oraz wrogimi chordami żołnierzy z Crynet Ops Infantry. Inaczej niż w pierwszej części, producenci postarali się o rozbudowaną fabułę gry. Śledzimy ją przy pomocy scenek-przerywników, konwersacji między postaciami oraz poprzez skanowanie zwłok.