Grając w Samurai Sword Destiny przenosimy się w czasie do średniowiecznej Japonii gdzie toczy się akcja. Wcielamy się w postać młodej samurajskiej wojowniczki Akane. Jej zadaniem jest rozwiązanie tajemnicy zaginięcia jej starszego brata. Gra oferuje dwa moduły. W pierwszym, poruszając się po dwuwymiarowej planszy musimy dotrzeć z jednego krańca na drugi.

Możemy tutaj dowolnie poruszać się po planszy skacząc, biegając, chodząc. Na swojej drodze dziewczyna napotyka wielu przeciwników (najczęściej mnichów i ninja), którzy mają magiczną moc, znają różne sztuczki i dysponują bronią. Sama może ich pokonać przy pomocy różnych technik ataków. Wychodząc z rozgrywek zwycięsko zdobywamy złoto, które między etapami gry możemy wymieniać na ulepszenie broni, umiejętności oraz zakupić nowe miecze. W drugim module gry nie panujemy nad poruszaniem się Akane, która biegnie przed siebie. Na drodze czeka na nią wiele przeszkód tj. pociski, czy strzały łuczników, które możemy pokonać przy dobrym refleksie.